使用Exiqon 在线工具设计 mRNAncRNA 引物

使用Exiqon在线工具设计mRNA/ncRNA引物

每一位用户都可以登陆EXIQON网站（），使用在线工具设计引物、探

针、Gapmer，也可以在线提交信息，定制合成属于您的LNA寡核苷酸。

TM

注册成为Exiqon会员，让设计操作更加方便！

进入Exiqon官方网站（），点击右上角“Sign In”进入注册页面，按

页面提示完成注册，开始便捷的在线设计体验！

开始设计引物

步骤1. 登录网址/custom-LNA-qPCR ，界面如下图所示：

步骤2. 点击“Design primers”，跳转至设计页面：

【*由于mRNA/ncRNA序列长，设计灵活性高，所以Exiqon的在线设计工具同样也提供了人

性化、智能化的设计方案，请点击/ls/Pages/查

看设计工具应用范围等详细介绍，帮助您快速顺利的完成设计。】

A

B

C

D

G

A. 从下拉列表中选择物种，目前在线工具能够提供人、大小鼠物种的引物设计

B. 通过输入特殊的序列ID（包括GenBank，RefSeq，Ensembl

中的注册ID或序列的特定关键词

，

例如：输入ID“NM_001101”或输入关键词“ACTB”）设计引物

C. 直接输入fasta、genbank、embl格式的序列或自行编辑的序列，最佳的输入方法是输入

FASTA格式的序列，理想的序列长度为50-20,000 nt，最低可达28nt，更短的（<27 nt）

序列请使用miRNA设计工具

D. 也可以上传电脑中保存的含目的序列的文件

E. 清除已输入的内容

F. 如有特殊要求，可进入高级选项页面，根据实验需要调整一些设计参数，对设计结果进行限

制，详细参数说明及调整方法请点击网址

/ls/Pages/

查看

G. 如有防止扩增到基因组DNA的需要，可勾选“

Automatically select intron spanning assays

”

H. 点击“Next”开始设计，页面进入设计状态如下图所示，设计过程需要几分钟，为了不耽误

您宝贵的时间，Exiqon提供了人性化的提醒设置，设计完毕会自动发送提醒邮件到您预留

的邮箱，请根据您的实际情况选择提醒功能。该邮件属于国际邮件，请不要使用QQ邮箱，

避免漏接。

I. 页面进入设计状态如下图所示，设计过程需要几分钟，为了不耽误您宝贵的时间，Exiqon

提供了人性化的提醒设置，设计完毕会自动发送提醒邮件到您预留的邮箱，请根据您的实际

情况选择提醒功能。该邮件属于国际邮件，请不要使用QQ邮箱，避免漏接。

E

F

H

步骤3. 经过几分钟精密内部计算，页面显示如下设计结果，按照得分从高到低的顺序排列，

第一对为最优候选引物，以此类推，可选一对或多对引物。页面还显示每个设计结果的扩增位置、

扩增产物长度以及扩增产物Tm值等信息，并有200次和500次两种规格可选：

A

A. 可以勾选理想的设计结果

C. 扩增产物的长度

E. 引物有2种规格可供选择

图中蓝线表示输入序列的总长，蓝线上方的灰色数字表示不同序号的设计结果的大致位置，上下

两条信息相同。点击左右箭头放大或缩小图标时，上方蓝线和数字没有变化，只有灰色的选取框

来回移动显示查看的具体区域，与此同时下方的蓝线和数字会相应的放大，帮助您更好的查看细

节，比如放大后就可以清楚查看2号设计结果的具体细节和信息，如下图所示：

B.引物扩增起始位置

D.扩增产物Tm值

F1/F2.将某个设计结果/将几个设计结果加入到购物篮中

F2

G

B C

D E

F1

G．点击“Details”，会出现不同设计结果具体的位置和序列信息，如下图所示：

步骤4. 将设计结果加入购物篮之后到页面上方查看，如下图所示，点击“Remove”可以移除

所选结果，重新选择；如果确认选择无误后点击“View basket”

步骤5. 购物篮页面如下图所示：

A. 选择合成份数

B. 确认无误后点击“Get quote”获取报价

B

A

如果想修改产品名称，可在此处操作

步骤6. 点击“Get quote”后页面跳转如下图所示，请准确填写必填项目，方便当地代理商与

您取得联系，提供报价、订货等服务。填写的“E-mail”邮箱将收到带有设计结果的PDF文件，

用于订货使用，该文件属于国际邮件，请不要使用QQ邮箱，避免漏接。

最后点击“submit”，完成整个设计操作，稍等片刻即可打开邮箱，查收PDF文件。

必填项目