非变性和变性聚丙烯酰胺凝胶的区别?“变性”体现在哪里?
作者: 墨池 (站内联系TA)    收录: 2011-07-31    发布: 2011-07-21
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1  非变性和变性聚丙烯酰胺凝胶的区别?“变性”体现在哪里?
2  SRAP标记用6%聚丙烯酰胺凝胶电泳,是变性还是非变性?配方是什么?配胶时,过硫酸铵是不是要最后加入?

谢谢(*^__^*) 嘻嘻
holyala (站内联系TA)
1. 变性胶加尿素或者其他变性剂,非变性胶是不加的。一般做RNA分离或回收、蛋白质分子量测定会使用变性PAGE,而DNA跑PAGE通常是采用非变性PAGE,另外回收活性蛋白也有用非变性PAGE的。
2. SRAP(貌似叫什么...相关序列扩增多态性)标记这个应该是非变性PAGE,6%的PAGE胶配方就不用发了吧,google一下一大堆。TEMED和过硫酸铵都是最后加,混匀后再灌胶。
墨池 (站内联系TA)
Originally posted by holyala at 2011-07-21 2121:
1. 变性胶加尿素或者其他变性剂,非变性胶是不加的。一般做RNA分离或回收、蛋白质分子量测定会使用变性PAGE,而DNA跑PAGE通常是采用非变性PAGE,另外回收活性蛋白也有用非变性PAGE的。
2. SRAP(貌似叫什么...相 ...
TEMED和过硫酸铵的先后呢?
todouhy (站内联系TA)
Originally posted by 墨池 at 2011-07-21 2138:
TEMED和过硫酸铵的先后呢?
最后加APS,也就是过硫酸铵,变性就是用缓冲液中加了SDS
changes (站内联系TA)
Originally posted by 墨池 at 2011-07-21 2019:
1  非变性和变性聚丙烯酰胺凝胶的区别?“变性”体现在哪里?
2  SRAP标记用6%聚丙烯酰胺凝胶电泳,是变性还是非变性?配方是什么?配胶时,过硫酸铵是不是要最后加入?

谢谢(*^__^*) 嘻嘻
1. “变性”体现在聚丙烯酰胺凝胶中加入尿素(一般跑DNA)或SDS(一般跑蛋白),另外,如果样品也要变性(DNA的loanding buffer也与普通的琼脂糖电泳所用的不同,同理所用Marker也不同;蛋白也要变性)。
2.SRAP一般用变性的聚丙烯酰胺,毕竟片段还是比较小。
3.配胶时不用加入过硫酸铵,灌胶前同时加入过硫酸铵(注意有毒!低温保存)和TEMED(也有毒,特臭)。

另外,这些问题貌似分子克隆那本书非常详细,只不过SRAP标记较新而已,没有收录,但是检测方法是通用的。请多多看书,祝实验好运!
墨池 (站内联系TA)
Originally posted by changes at 2011-07-21 2107:
1. “变性”体现在聚丙烯酰胺凝胶中加入尿素(一般跑DNA)或SDS(一般跑蛋白),另外,如果样品也要变性(DNA的loanding buffer也与普通的琼脂糖电泳所用的不同,同理所用Marker也不同;蛋白也要变性)。
2.SRAP一般 ...
你说SRAP是变性的,我看师姐的配胶过程没有一点体现变性的物质。
changes (站内联系TA)
Originally posted by 墨池 at 2011-07-21 2104:
你说SRAP是变性的,我看师姐的配胶过程没有一点体现变性的物质。
非变性胶也可以,但是分辨率会低些。另外,你是用SRAP标记做什么的,多态性还是标记目的基因或遗传图谱构建?
冼亮淀粉酶 (站内联系TA)
APS和TEMED虽然不好,但也比不上丙烯酰胺有神经毒性,可随皮肤渗入人体,所以我是什么东西都加完之后最后加丙烯酰胺。
holyala (站内联系TA)
Originally posted by 冼亮淀粉酶 at 2011-07-22 0727:
APS和TEMED虽然不好,但也比不上丙烯酰胺有神经毒性,可随皮肤渗入人体,所以我是什么东西都加完之后最后加丙烯酰胺。
...额~~话说我们一般都是把丙烯酰胺和甲叉丙烯酰胺配成40%的母液,用的时候根据所需要的浓度加一定量的母液即可。要是每次都搞丙烯酰胺来配,那谁受得了啊。。。
holyala (站内联系TA)
Originally posted by changes at 2011-07-21 2107:
1. “变性”体现在聚丙烯酰胺凝胶中加入尿素(一般跑DNA)或SDS(一般跑蛋白),另外,如果样品也要变性(DNA的loanding buffer也与普通的琼脂糖电泳所用的不同,同理所用Marker也不同;蛋白也要变性)。
2.SRAP一般 ...
这个我有点问题...跑DNA的PAGE电泳要用变性胶么?根据我的经验,双链DNA跑尿素PAGE的时候由于变性导致双链打开,电泳图会非常难看,原本的单一条带会变成非常接近的两个条带。嗯,不过我这种情况是DNA片段较大(>50bp)的时候,不知道十几个bp的DNA会怎样。so...我只用过尿素PAGE分离回收RNA的说...
空谷幽风 (站内联系TA)
变性聚丙烯酰胺电泳buffer里面含尿素等变性剂 pcr产物dna双链会解离成为单链

非变性电泳不会解链 dna以双链形式电泳
墨池 (站内联系TA)
Originally posted by changes at 2011-07-21 2202:
非变性胶也可以,但是分辨率会低些。另外,你是用SRAP标记做什么的,多态性还是标记目的基因或遗传图谱构建?
多态性。一种观赏花卉50个品种的遗传多样性分析
墨池 (站内联系TA)
Originally posted by holyala at 2011-07-22 1055:
...额~~话说我们一般都是把丙烯酰胺和甲叉丙烯酰胺配成40%的母液,用的时候根据所需要的浓度加一定量的母液即可。要是每次都搞丙烯酰胺来配,那谁受得了啊。。。
你理解有误,我们说的就是指母液,不知道你怎么理解成这样了
holyala (站内联系TA)
Originally posted by 墨池 at 2011-07-22 1320:
你理解有误,我们说的就是指母液,不知道你怎么理解成这样了
不知道是哪里的问题啊...如果我理解不对的话,那么冼亮淀粉酶大大说的:“APS和TEMED虽然不好,但也比不上丙烯酰胺有神经毒性,可随皮肤渗入人体,所以我是什么东西都加完之后最后加丙烯酰胺。” 意思难道是所有东西都加好,最后再取母液吗??这种配胶的顺序到是蛮新奇的...
changes (站内联系TA)
Originally posted by 墨池 at 2011-07-22 1313:
多态性。一种观赏花卉50个品种的遗传多样性分析
多态性的话建议使用变性胶检测,使用大板、长板,那样跑出来相当漂亮,也方便统计条带。
另外,材料的亲缘关系最好也明确,对于最终结果的分析有帮助。
:P
墨池 (站内联系TA)
Originally posted by holyala at 2011-07-22 1454:
不知道是哪里的问题啊...如果我理解不对的话,那么冼亮淀粉酶大大说的:“APS和TEMED虽然不好,但也比不上丙烯酰胺有神经毒性,可随皮肤渗入人体,所以我是什么东西都加完之后最后加丙烯酰胺。” 意思难道是所 ...
他是简略回答好不好,就是指母液啦
墨池 (站内联系TA)
Originally posted by changes at 2011-07-22 1422:
多态性的话建议使用变性胶检测,使用大板、长板,那样跑出来相当漂亮,也方便统计条带。
另外,材料的亲缘关系最好也明确,对于最终结果的分析有帮助。
:P
变性胶的配方有么?可否参考一下下(*^__^*) 嘻嘻……

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变性,使用,双链,多态性,尿素,母液